MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 2647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017177	TTA	2	6	1058	1063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017177	T	6	6	1080	1085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017177	ATA	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017177	ATCAGA	2	12	1126	1137	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017177	A	6	6	1137	1142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017177	GAA	2	6	1145	1150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017177	TCT	2	6	1153	1158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017177	A	6	6	1166	1171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017177	AAGA	2	8	1184	1191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017177	TCTA	2	8	1210	1217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017177	ATTT	2	8	1218	1225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017177	TTTA	2	8	1261	1268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017177	TCT	2	6	1283	1288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017177	CTC	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017177	T	7	7	1334	1340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017177	TA	3	6	1363	1368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017177	T	6	6	1416	1421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017177	CAT	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017177	ATT	2	6	1507	1512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017177	TCAA	2	8	1514	1521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017177	TTC	2	6	1567	1572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017177	TTTA	2	8	1573	1580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017177	CATA	2	8	1591	1598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017177	ATAG	2	8	1612	1619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017177	TTA	2	6	1625	1630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017177	AAG	2	6	1636	1641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017177	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017177	TATT	2	8	1698	1705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017177	TCCT	2	8	1748	1755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017177	TAT	2	6	1763	1768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017177	TAAA	2	8	1773	1780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017177	TA	3	6	1798	1803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017177	A	7	7	1806	1812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017177	A	6	6	1855	1860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017177	ATA	3	9	2338	2346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017177	TA	3	6	3147	3152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017177	T	7	7	3163	3169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017177	AT	3	6	3179	3184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017177	TA	3	6	3196	3201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017177	ATGG	2	8	3222	3229	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017177	ATA	2	6	3236	3241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017177	T	6	6	3251	3256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017177	TA	3	6	3263	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017177	AAATTA	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017177	TTA	2	6	3363	3368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017177	TGA	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017177	T	6	6	3383	3388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017177	A	7	7	3419	3425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017177	AT	3	6	3429	3434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017177	TAAA	2	8	3440	3447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017177	A	7	7	3456	3462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017177	TAT	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017177	ATT	2	6	4236	4241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017177	A	6	6	4255	4260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017177	TAT	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017177	A	6	6	4300	4305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017177	TA	3	6	4309	4314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017177	CAA	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017177	A	8	8	4321	4328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017177	ATA	2	6	4333	4338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017177	TAT	2	6	5379	5384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017177	AAATA	2	10	5400	5409	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017177	TAA	2	6	5410	5415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017177	AT	3	6	5416	5421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017177	AAT	2	6	5423	5428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017177	ATATTA	2	12	5442	5453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017177	A	6	6	5465	5470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017177	TAA	2	6	5480	5485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017177	TAA	3	9	5488	5496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017177	GAG	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017177	AATTG	2	10	5529	5538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017177	ATT	2	6	5558	5563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017177	A	7	7	5895	5901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017177	ATC	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017177	T	6	6	6344	6349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017177	TAAAA	2	10	6358	6367	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017177	A	6	6	6364	6369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017177	TAT	2	6	6377	6382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017177	ATA	2	6	6386	6391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017177	T	9	9	6404	6412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017177	ATG	2	6	6424	6429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017177	AT	3	6	6441	6446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017177	TATT	2	8	6518	6525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017177	AATA	2	8	6537	6544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017177	TTA	2	6	7126	7131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017177	AT	3	6	7166	7171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017177	A	6	6	7180	7185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017177	AT	3	6	7194	7199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017177	TA	3	6	7212	7217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017177	AGG	2	6	8068	8073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017177	TAT	2	6	9246	9251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017177	AT	3	6	9250	9255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017177	AAT	2	6	9256	9261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017177	TAT	2	6	9274	9279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017177	ATT	2	6	9290	9295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017177	AT	3	6	9315	9320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017177	AT	3	6	9335	9340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017177	ATG	2	6	9344	9349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017177	GAG	2	6	9361	9366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017177	ATA	2	6	9870	9875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017177	A	6	6	9900	9905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017177	TAT	2	6	9908	9913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017177	ATATA	2	10	9914	9923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017177	A	6	6	10507	10512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017177	A	7	7	10521	10527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017177	T	7	7	10558	10564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017177	TAA	2	6	10581	10586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017177	TA	3	6	10608	10613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017177	TAAATT	2	12	10636	10647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017177	TAAT	2	8	10648	10655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017177	AT	3	6	10658	10663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017177	T	8	8	10691	10698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017177	A	6	6	10731	10736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017177	AGG	2	6	10756	10761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017177	GGA	2	6	12711	12716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017177	TTTA	3	12	12729	12740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017177	AT	3	6	12757	12762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017177	TAAA	2	8	13027	13034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017177	AAAT	2	8	13050	13057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017177	T	7	7	13074	13080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017177	TC	3	6	13092	13097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017177	CT	3	6	13143	13148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017177	TAT	2	6	13179	13184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017177	TTAAA	3	15	13187	13201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017177	A	7	7	13199	13205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017177	T	7	7	13210	13216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017177	ACA	2	6	13228	13233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017177	TA	3	6	13249	13254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017177	A	6	6	13265	13270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017177	TTATG	2	10	13273	13282	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017177	TTA	2	6	13297	13302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017177	TAAC	2	8	13303	13310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017177	GGA	2	6	13348	13353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017177	ATT	2	6	13692	13697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017177	CTT	2	6	13704	13709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017177	GTTTT	2	10	13710	13719	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017177	T	7	7	13716	13722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017177	TAAAG	2	10	13735	13744	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017177	ATC	2	6	13782	13787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017177	T	6	6	13811	13816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017177	T	7	7	13820	13826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017177	CCTAAA	2	12	13831	13842	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017177	TAAT	2	8	13865	13872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017177	TAA	2	6	13888	13893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017177	AT	4	8	13901	13908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017177	A	7	7	13911	13917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017177	ATTAT	2	10	13919	13928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017177	T	9	9	13935	13943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017177	TA	3	6	13945	13950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017177	AT	3	6	13958	13963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017177	TAAA	2	8	13966	13973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017177	ATA	2	6	13974	13979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017177	AAAT	2	8	14004	14011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017177	TAA	2	6	14028	14033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017177	TA	3	6	14095	14100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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